على مطهرى نایب رئیس مجلس شوراى اسلامى مى‌گوید پدرم استثنایى بر قاعده حوزه‌هاى علمیه زمان خود بود. فلسفه مى‌دانست، با آثار کانت و هگل آشنایى داشت. در منبر از حافظ و مولانا سخن مى‌گفت، در مجله زن روز قلم مى‌زد و با روشنفکران و آکادمیسین‌هاى کت و شلوارپوش و کراواتى نشست و برخاست داشت. او در دورانى که از هر سو طبل اختلافات کوبیده مى‌شد بر وحدت شیعه و سنى تاکید مى‌ورزید.
على مطهرى به روزنامه اعتماد گفته پدرم از سبک و سیاق روضه‌خوانى‌ها رسما انتقاد مى‌کرد و با توجه به نیازهاى زمان و مقتضیات جوامع مدرن در خوانش اسلام تاکید مى‌کرد.
وى گفته پدرم با ورود روحانیت به مناصب دولتى مخالف بود. مهندس بازرگان را فرد شایسته‌اى مى‌دانست.
مطهرى تاکید کرده که تصمیمات شوراى نگهبان با آراى پدرم تطابق ندارد. طبق نظر پدرم معناى ولایت فقیه سرسپردگى جامعه و اقشار مختلف آن به شخص ولى فقیه نیست بلکه ولایت مکتب، ایدئولوژى و در واقع ولایت فقیه ولایت شخص نیست بلکه ولایت مکتب است، پدرم تاکیدداشت عقل هیچگاه تعطیل نمى‌شود اینها همان نظارتى است که از حوزه‌هاى علمیه توقع مى‌رود.
آیت‌الله مطهرى اوایل انقلاب به وسیله گروهی به نام «فرقان» ترور شد.
