رییس سازمان اطلاعات آمریکا، ضمن هشدار به دونالد ترامپ، رییس جمهوری منتخب این کشور، لغو توافقنامه هسته‌ای با ایران را یک «فاجعه» خواند و گفت :« چنانچه وی بخواهد تهدیدهایش را در این زمینه به اجرا بگذارد نهایت حماقت خواهد بود.»
جان برنان همچنین در مصاحبه‌ای با شبکه جهانی بی‌بی‌سی، با اشاره به مقصر دانستن مسکو در در رنجی که مردمان سوریه متحمل شده‌اند، به ترامپ توصیه کرد که نسبت به وعده‌های روسیه، جانب احتیاط را رعایت کند.
دونالد ترامپ در کارزار انتخاباتی خود ایران را تهدید کرده بود که توافق هسته‌ای با ایران را پاره خواهد کرد و به ایجاد روابط نزدیک به روسیه تاکید کرده بود.
برنان در مصاحبه‌اش همچنین تاکید کرده است که دولت جدید باید با «تدبیر و پرنسیپ»بیشتری در مورد روابط‌اش با روسیه، موضوع توافق هسته‌ای با ایران و دقت در استفاده از واژه‌ها برای بیان مواردی مانند «تروریست» برخورد کند.
به گفته برنان، اگر دولت ترامپ بخواهد توافق هسته‌ای را که در دولت قبلی حاصل شده است، با ایران لغو کند، بی‌سابقه خواهد بود.
رییس سازمان سیا همچنین تاکید کرد: «چنین اقدامی، موضع تندروها را در حکومت جمهوری اسلامی تقویت خواهد کرد.»
برنان همچنین افزود: «اگر ایران برنامه هسته‌ای خود را در واکنش به لغو این توافقنامه از سوی دولت ترامپ دوباره از سر بگیرد، خطر از سر گرفتن برنامه‌های هسته‌ای سایر کشورهای منطقه نیز افزایش می‌یابد.»
وی در واکنش به شعارهای انتخاباتی رییس جمهوری منتخب آمریکا مبنی بر حمایت وی در استفاده از فشار بر مظنونان به اقدامات تروریستی برای گرفتن اطلاعات و جلوگیری از فعالیت آنها، «استفاده از روش ایجاد احساس خفگی در آب» را به شدت مورد انتقاد قرار داد و گفت سوء استفاده از قدرت توسط آمریکا، «تروریست» و «افراط گرایان» را بیشتر در مقابل آمریکا قرار می‌دهد و وسیله بهره‌برداری تبلیغاتی آنها را بیش از پیش مهیا می‌سازد.
رییس سازمان اطلاعات ایالات متحده همچنین در واکنش به سخنان برخی از اعضای دولت جدید مانند ژنرال مایکل فلین که به عنوان مشاور امنیت ملی رییس جمهوری منتخب آمریکا، معرفی شده و پیشتر ادعا کرده بود «دولت آمریکا درگیر جنگ جهانی با مسلمانان افراطی است» گفت: «اعضای کابینه جدید باید در رفتار و بیان و پیامی که می‌فرستند پرنسیپ‌ها را رعایت کنند.»
وی گفت:«آنها ممکن است با سوء استفاده از چنین پیام‌هایی دولت آمریکا را یک دولت ضد اسلامی معرفی کنند که در واقع چنین نیست.»
رییس سازمان سیا در ژانویه سال آینده، پس از گذشت چهار سال از ریاست‌اش، از سمت خود کناره‌گیری خواهد کرد.
