مذاکرات سیاسی جمهوری اسلامی با گروه طالبان مخالفان زیادی در بین مقامهای سیاسی و مردم افغانستان دارد. معاون وزیر خارجه افغانستان در واکنش به ظریف با یادآوری آزادی‌های موجود در افغانستان گفت که «تهران هراس دارد آزادی‌های موجود در افغانستان به الگویی برای ایران بدل شود.»
ادریس زمان معاون سیاسی وزیر امور خارجه افغانستان با تاکید بر اینکه «مقامات وزارت خارجه ایران این روزها در نقش سخنگویان طالبان عمل می‌کنند» به شدت از سخنان جواد ظریف درباره امور داخلی افغانستان و روابط دولت این کشور و طالبان انتقاد کرد.
محمدجواد ظریف در جریان سفر به هندوستان در مصاحبه با تلویزیون NDTV گفت، «ترسیم آینده افغانستان بدون در نظر گرفتن طالبان، غیرممکن است.» او همچنین عنوان کرده بود «ما در منطقه و فراتر از آن، برای کمک به افغان‌ها در این تصمیم باید زمینه‌سازی کنیم نه این که تحمیل کنیم. فکر می‌کنم هیچ کس در منطقه، دولتی تحت سلطه طالبان را به نفع امنیت منطقه نمی‌داند. فکر کنم در این زمینه تقریبا یک اتفاق نظر وجود دارد.»
ادریس زمان در واکنش به این سخنان، این مواضع را مداخله‌جویانه دانست و گفت: «ایران از یک افغانستان دموکراتیک که در آن آزادی بیان و حقوق مدنی و شهروندی تضمین شده باشد به شدت نگران است… رسانه‌ای آزاد (در ایران) وجود ندارد. دولت ایران در هراس است که آزادی‌های موجود در افغانستان به الگو برای ایران بدل شود. به همین دلیل ایران طرفدار اندیشه‌های ملاعمر در افغانستان است.»
وحید عمر سفیر افغانستان در ایتالیا نیز در پاسخ اظهارات ظریف، در صفحه توئیترش نوشت: «دوستان ایرانی ما؛ ما ممکن است که طالبان را وارد [قدرت] بکنیم یا نکنیم. اما از شما برای توصیه[ای که کردید] سپاسگزاریم. برای حسن همجواری متقابل، از شما می‌خواهم که قدرت را با سازمان مجاهدین خلق و شورای ملی مقاومت ایران تقسیم کنید، کروبی و موسوی را آزاد کنید و با سعودی صلح کنید. زیرا که ما فکر می‌کنیم این برای شما خوب است.»
پیش از او نیز شاه‌حسین مرتضوی معاون سخنگوی رئیس‌جمهوری افغانستان، پنجشنبه ۲۰ دی، در فیس‌بوک خود مقامات وزارت خارجه رژیم ایران را متهم کرد که این روزها در نقش سخنگویان طالبان عمل می‌کنند. وی با اشاره به مذاکرات جمهوری اسلامی با طالبان افغانستان نوشت که اگر ایران به گفتگو برای پیدا کردن راه‌حل سیاسی اعتقاد دارد «چرا راه گفتگو با گروه‌های مخالف داخلی خود از جمله مجاهدین خلق را بسته است؟»
او همچنین با کنایه مینویسد، «سوال عمده از مقامات ایرانی این است که یا درباره قتل دیپلماتهای کشته شده خود در مزار[شریف] از هیات طالبان سوالی داشتهاند؟»
جمهوری اسلامی سالهاست با طالبان ارتباط تنگاتنگ و غیرعلنی دارد اما میگوید گفتگوهای رسمی با طالبان را به درخواست و با دعوت مسئولان افغانستان برای رسیدن به صلح در این کشور دنبال میکند. روی دیگر این سکه اختلاف درونی بین مقامهای سیاسی افغانستان است. بسیاری از آنها جمهوری اسلامی را از عوامل بیثباتی منطقه و حتی افغانستان میدانند و مخالف حضور ایران در جریان مذاکرات صلح با طالبان هستند.
مقامهای ارشد امنیتی افغانستان سپاه پاسداران و کنسول رژیم در هرات را متهم به دست داشتن در قتلها و ترورهای سازماندهی شده می‌کنند.
مقام های افغانستان که تا دیروز با آخوندها جیک تو جیک بودند باید میدانستند نزدیکی با یک مشت شیاد نکبت ببار میاورد نه ارمغان، مقام های افغانستان باید بیدار شوند آخوند آمده همه ما را به خاک سیاه بنشاند، شما هم بروید با مریم رجوی و رضا پهلوی دیدار کنید