وزارت دفاع جمهوری آذربایجان بطور رسمی از وزارت دفاع روسیه و فرماندهی نظامیان روسی مستقر در منطقه قره‌باغ درخواست کرده تا از عبور کامیون‌های ایران به این منطقه جلوگیری کنند.
به گزارش خبرگزاری «آناتولی» وزارت دفاع جمهوری آذربایجان در بیانیه‌ای که ۱۲ سپتامبر (۲۱ شهریور) منتشر شد اعلام کرد ورود افراد حقیقی و حقوقی و وسایل نقلیه سایر کشورها به خاک آذربایجان بدون رضایت آذربایجان خلاف قوانین این کشور و مغایر با توافق رؤسای جمهور آذربایجان، ارمنستان و روسیه در نوامبر سال ۲۰۲۰ است.
پس از اعلام آتش‌بس میان آذربایجان و ارمنستان در جنگ قره‌باغ نیروهای روسی بطور موقت در این منطقه مستقر شدند و نظارت و کنترل مرزی به آنها واگذار شد.
اخیراً تصاویری در شبکه‌های اجتماعی منتشر شده که تردد کامیون‌ها و تانکرهای سوخت با پلاک ایران به مناطق تحت کنترل نیروهای روسیه در قره‌باغ را نشان می‌دهند.
جمهوری آذربایجان پیش از این در ماه اوت نیز از جمهوری اسلامی ایران خواسته بود که از ورود غیرقانونی کامیون‌های این کشور به قره‌باغ جلوگیری کند.
منابع امنیتی جمهوری آذربایجان گزارش می‌دهند جمهوری اسلامی اقدام به قاچاق انواع کالا به منطقه قره‌باغ می‌کند.
روح‌الله لطیفی سخنگوی گمرک جمهوری اسلامی پنجم شهریور گفت «بر اساس اخبار رسیده از برخی رانندگان سواری، ورودی از سمت ارمنستان، جاده گوریس- قاپان به سمت ارمنستان توسط نیروهای کشور آذربایجان مسدود شده است.»
مقامات جمهوری آذربایجان می‌گویند جمهوری اسلامی با رفتارهای دوگانه و اقدامت مشکوک اقدام به حمایت از دولت ارمنستان می‌کند.
علی خامنه‌ای رهبر جمهوری اسلامی جمهوری آذربایجان را هم بخشی از «سرزمین‌های اسلامی» می‌داند با اینهمه اما مقامات جمهوری آذربایجان ترجیح می‌دهند همکاری‌های اقتصادی و سیاسی خود را نه با ایران بلکه با ترکیه گسترش دهند.
هرچند در سکوت اما به هر حال روابط تهران و باکو عادی نیست و اختلافات سیاسی در مواقعی به شکل‌های مختلف در مناسبات طرفین به ویژه در مسائل مرزی و نظامی به صورت خفیف بروز می‌کند. جمهوری آذربایجان در سال‌های اخیر از نظر نظامی و امنیتی همکاری‌های ویژه‌ای را با اسرائیل آغاز کرده و از نظر سیاسی و اقتصادی با ترکیه مراودات بسیار دارد.
در شهریور ۱۳۹۳ یک پهپاد در حوالی تأسیسات اتمی نطنز سقوط کرد. مقامات جمهوری اسلامی مدعی شدند این پهپاد اسرائیلی بوده و از خاک جمهوری آذربایجان به پرواز درآمد و وارد ایران شد.
اینهمه در حالیست که در جریان جنگ قره‌باغ ترکیه بطور آشکار از جمهوری آذربایجان حمایت نظامی و لجستیک کرد و همکاری‌های نظامی جمهوری آذربایجان و ترکیه همچنان رو به افزایش است. هم‌اکنون نیز رزمایش مشترک نیروهای مسلح ترکیه، آذربایجان و پاکستان با عنوان «سه برادر ۲۰۲۱» در باکو آغاز شده و تا آخر سپتامبر ادامه خواهد داشت.
خاک تو سرت خامنه ای، اون محور مقاومت تو سرت بخوره
بیمقدارتر از آنی که با اینهمه خفت و نکبتی که برای خودت کسب کردی وعلیرغم کثافتی که رهبرت، ژنرال پوتین، نثارتو کرد هنوز موجودیتی برای خود و نسل منفورت متصور هستی
خاک تو سرت خامنه ای