به گفته سخنگوی کمیسیون تلفیق بودجه ۹۸ میزان فرار مالیاتی پزشکان بیش از ۶۵۰۰ میلیارد تومان است. این رقم به دلیل «ضعف سازوکارهای قانونی و عدم اتصال پایگاه‌های اطلاعاتی به یکدیگر» از درآمدهای کشور حذف شده است.
محمدمهدی مفتح سخنگوی کمیسیون تلفیق بودجه ۹۸ گفته است میزان فرار مالیاتی پزشکان حداقل حدود ۶۵۰۰ میلیارد تومان است. به گفته مسئولان سازمان امور مالیاتی، میزان مالیات پرداختی توسط پزشکان در سال گذشته حدود ۱۵۰ میلیارد تومان بوده است که بر اساس گزارش مرکز پژوهش‌های مجلس مقدار واقعی مالیات پزشکان در سال حداقل حدود ۶۷۰۰ میلیارد تومان تخمین زده می‌شود.
اکنون محمدمهدی مفتح می‌گوید در صورتی که راهکاری برای دریافت مالیات از پزشکان در نظر گرفته شود مبلغ ۶۵۰۰ تا ۸۰۰۰ میلیارد تومان به درآمد کشور افزوده خواهد شد.
مرکز پژوهش‌های مجلس شورای اسلامی نیز در گزارشی عنوان کرده که «به دلیل ضعف ساز و کارهای قانونی» و «عدم اتصال پایگاه‌های اطلاعاتی به یکدیگر» توان اخذ مالیات واقعی بسیاری از مشاغل در کشور امکان‌پذیر نیست. این گزارش حوزه سلامت را به عنوان موردی برجسته مثال زده و نوشته است «کارشناسان این حوزه مقدار واقعی مالیات پزشکان را حداقل حدود ۶۷۰۰ میلیارد تومان در سال تخمین می‌زنند.»
سازمان امور مالیاتی مالیات پزشکان را حدود ۷۰۰ میلیارد تومان در سال تخمین زده است. این در حالیست که بسیاری از کارکنان بخش دولتی و خصوصی که معمولاً قشر ضعیف‌تری در جامعه هستند مالیات‌های خود از جمله مالیات حقوق را به طور کامل پرداخت می‌کنند و یا به صورت اجباری از حقوق آنها کسر می‌شود. با توجه به این مسئله ایجاد سازوکاری برای اخذ مالیات از مشاغل و جلوگیری از فرار مالیاتی آنها ضروری به نظر می‌رسد.
بر اساس گزارش‌‌ها عدم استفاده پزشکان از دستگاه کارت‌خوان و پرداخت وجه نقد از بیماران موجب می‌شود درآمد واقعی آنها کمتر نشان داده شود. همچنین برخی از پزشکان مبالغی که تحت عنوان ویزیت و خدمات سرپایی در مطب از بیماران دریافت می‌کنند را به حساب منشی خود واریز و به این ترتیب یک فرار مالیاتی بزرگ را رقم می‌زنند.
غلامعلی جعفرزاده ایمن آبادی عضو کمیسیون برنامه و بودجه مجلس شورای اسلامی در این‌باره گفته است: «برخی پزشکان متاسفانه با استفاده از راه‌های گوناگون سعی می‌کند تا درآمد خود را پنهان کنند به طوری که از این افراد، درآمدها و واریزی‌های خود را به حساب منشی خود داشته و دارند و می‌کوشند تا ردپایی از این درآمدها وجود نداشته باشد. پزشکان باید به مانند دیگر اقشار جامعه و بر اساس درآمدشان، مالیات بپردازند و هیچ‌کس هم با درآمد و حتی افزایش درآمدهای آنها کاری ندارد ولی باید به ازای درآمد خود و به تناسب آن، مالیات‌های خود را که ادای وظیفه به کشور است پرداخت کنند.»
بر اساس آمارهای وزارت بهداشت نزدیک به ۸۳هزار پزشک در ایران به کار مشغول هستند و در مطب‌هایشان بیماران را ویزیت می‌کنند. جالب اینکه پزشکان از اقشار پردرآمد در ایران هستند و به نظر می‌رسد بیشترین فرار مالیاتی نیز به این صنف تعلق داشته باشد.
