وزارت خارجه جمهوری اسلامی روزچهارشنبه ۱۶ اردیبهشت ۱۴۰۵ در اطلاعیهای حملات موشکی و پهپادی ایران به امارات را «ادعاهای بیاساس» خواند و هشدار داد این کشور «از ادامه همدستی با آمریکا و اسرائیل خودداری کند.»
وزارت امورخارجه جمهوری اسلامی مدعی شد، اقدامات دفاعی نیروهای مسلح ایران منحصراً متوجه دفع شرارت آمریکاییها بوده است.

قرارگاه مرکزی خاتمالانبیا نیز سهشنبه شب ۱۵ اردیبهشت ۱۴۰۵ رسماً اعلام کرد نیروهای مسلح جمهوری اسلامی در روزهای گذشته هیچگونه عملیات موشکی و پهپادی علیه کشور امارات انجام ندادهاند. این در حالیست که وزارت دفاع امارات اعلام کرد چندین موشک و پهپاد از ایران به آن کشور پرتاب شد و برخی از آنها نیز باعث انفجار در تاسیسات نفتی و بنادر امارات شد.
سخنگوی قرارگاه مرکزی خاتمالانبیا تأکید کرد، «چنانچه اقدامی [علیه امارات] صورت میگرفت، با قاطعیت و صراحت آن را اعلام میکردیم؛ لذا گزارش وزارت دفاع آن کشور بهطور مطلق تکذیب میشود و عاری از هرگونه صحت است.»
قرارگاه خاتمالانبیا به مقامات اماراتی هشدار داده که «کشور شما نباید بهعنوان یک سرزمین اسلامی، لانهٔ آمریکاییها و صهیونیستها و نیرو و تجهیزات نظامی آنها قرار گیرد و به جهان اسلام و مسلمانان، خیانت کند.»
او ادامه داد: «با کمال تأسف باید گفت کشور امارات امروز به یکی از پایگاههای اصلی آمریکایی و صهیونیستی بهعنوان دشمنان جهان اسلام و عامل اصلی ناامنی در منطقه، تبدیل گردیده است و محل استقرار بخش عمدهای از نیرو و تجهیزات نظامی آنها شده است. با جوسازی، تهمت زدن و مظلومنمایی، نمیتوان مشکلی را حل کرد و فضای بینالمللی را مخدوش نمود.»
علی مطهری نایب رئیس پیشین مجلس شورای اسلامی در برنامه «سپهر سیاست»، حمله به امارات را «تیر غیب» خواند و گفت: «منشأ دقیق این حادثه مشخص نیست، اینکه از کجا بوده، دقیق نمیدانیم، اما به نظر من حقش بود.»
انور قرقاش روز سهشنبه، ۱۵ اردیبهشت ۱۴۰۵، در پیامی در شبکه اجتماعی «ایکس»، حملات اخیر به خاک امارات را «وحشیانه» و «متجاوزانه» توصیف کرد. وی با بیان اینکه جمهوری اسلامی منبع اصلی تهدید و بیثباتی در منطقه است، اظهار داشت: «رژیم ایران با این اقدامات، مسئولیت کامل تشدید بحران در منطقه خلیج فارس را بر عهده دارد.»
چندین کشور غربی و منطقهای از جمله عربستان، اردن، پاکستان، قطر و مصر حملات جمهوری اسلامی به امارات را شدیداً محکوم کرده بودند.

